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犹素化组学服务全球首发!一文带你破局内卷,勇闯类泛素化修饰研究新赛道!

2025-08-01
中科新生命
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中科新生命于近日发布了4种新型修饰组学服务(犹素化、酪氨酸硝基化、赖氨酸亮氨酰化、D-乳酸化),其中犹素化、酪氨酸硝基化、赖氨酸亮氨酰化组学服务为全球首发,助力研究者从蛋白翻译后修饰角度解析生理病理机制。本篇文章我们聚焦犹素化——一种重要的类泛素化修饰

犹素化(UFMylation): 又被称为UFM1修饰。该修饰是在酶的作用下,将犹素分子(UFM1)共价连接到底物蛋白质赖氨酸残基上。参与修饰的酶为E1 UFM1-激活酶 UBA5、E2 UFM1-结合酶UFC1和E3 UFM1-连接酶UFL1。犹素化是一种可逆修饰,去犹素化过程由去修饰酶UFSP蛋白催化。由于UFM1分子和泛素分子在三维结构上高度相似,且都由E1-E2-E3构成的酶系统催化发生,因此是一种类泛素化修饰[1]

犹素化和去犹素化过程 

犹素化首次于2004年被报道 [2],已被发现协调了一系列重要的生物学功能,包括蛋白质稳态、DNA损伤反应(DDR)、内质网(ER)应激反应、调节自噬功能和影响免疫反应。还有证据表明其参与线粒体和核糖体相关的蛋白质质量控制。在肿瘤、炎症及免疫响应、神经退行性疾病等疾病中都有犹素化参与调控的身影 [1]。以下,我们特别为大家整理了犹素化在不同研究领域的重要成果。

 

 

肿瘤

#01

 

1.肿瘤生长和形成

 

肿瘤抑制因子p53是各种关键细胞过程的中枢调控因子,其稳定性受多种翻译后修饰(如泛素化和类泛素化修饰)的调控。研究表明p53是犹素化修饰的底物,犹素化通过与MDM2介导的泛素化修饰竞争以提高p53的稳定性,从而维持p53的肿瘤抑制功能。p53犹素化下降会降低p53稳定性,进而促进细胞生长和体内肿瘤形成[3]。 

犹素化调控p53蛋白稳定性

 

 

2.肿瘤转移

 

肿瘤转移作为恶性肿瘤标志性的病理特征,是临床治疗失败和患者死亡的首要原因。肿瘤细胞迁移是关键环节,细胞迁移的驱动力主要来源于其前沿形成的片状伪足(lamellipodia),研究表明UFM1特异性E3连接酶1(UFL1)UFL1能够在体内外催化ArpC4发生犹素化修饰,激活Arp2/3复合体促进伪足形成,从而加速肿瘤转移过程[4]。 

 

 

3.肿瘤免疫

 

尽管PD-1/PD-L1抗体对一些患者表现出持久的治疗效果,但仍有大部分患者会出现无效或耐药现象。研究发现T细胞中AMP-活化蛋白激酶(AMPK)会使 UFL1(犹素化E3 连接酶) 的 T536 发生磷酸化,导致 PD-1犹素化减少,进而破坏 PD-1 的稳定性。这种不稳定性反过来又增强了 CD8+ T 细胞的活化和抗肿瘤免疫力,揭示了犹素化在调控免疫检查点PD-1以及CD8+ T细胞的抗肿瘤免疫中的关键作用[5]。 

AMPK-UFL1-PD-1信号轴在肿瘤免疫调节中的分子机制模式图

 

另有研究表明PD-L1的犹素化通过协同其泛素化破坏PD-L1的稳定性。在人和小鼠癌细胞通过沉默UFL1或UFM1抑制PD-L1的犹素化来稳定PD-L1,从而破坏抗肿瘤免疫[6]

肿瘤微环境中PD-L1的犹素化和异常犹素化工作模型

 

 

免疫

#02

 

1.NLRP3炎症小体激活

 

NLRP3炎症小体的异常激活与多种炎症性疾病有关,包括自身免疫性疾病、癌症、代谢性疾病、心血管功能障碍、神经系统疾病和COVID-19等。研究发现,Ufm1 E3连接酶Ufl1与NLRP3相互作用并催化NLRP3的犹素化,通过NLRP3的NACHT结构域特异性结合,靶向关键赖氨酸位点阻止其自噬降解,并促进NLRP3炎症小体激活。以上表明,靶向犹素化可能是控制炎症性疾病的潜在治疗策略[7]。 

Ufl1 介导的 NLRP3 的犹素化

 

 

2.细胞免疫反应

 

巨噬细胞由干扰素-γ(IFN-γ)、脂多糖(LPS)等信号激活,其主要功能是强力杀伤病原体、清除坏死组织。研究发现犹素化对IFN-γ和脂多糖(LPS)等信号具有抑制作用。犹素化缺陷导致细胞中IFN-γ的激活增强,并且确定了犹素化途径中三种关键酶(Ufc1、Uba5 和 Ufsp2)的发挥重要作用,定义了犹素化和Ern1/Xbp1介导的内质网应激反应对促炎刺激激活巨噬细胞的反应之间的联系[8]。 

 

 

神经科学

#03

 

1.阿尔茨海默病

 

在人类阿尔茨海默病的大脑中,犹素化修饰途径发生了显著变化。这些变化与病理性的 tau 蛋白显著相关,这意味着犹素化修饰级联反应确实可能在人类大脑中对 tau 病理起到调节作用[9]。 

 

 

2.大脑发育

 

早年研究也发现 UBA5(犹素化E1激活酶)的双等位基因突变会导致严重的早发性脑病和进行性小头畸形,证明了犹素化在人脑发育中起着至关重要的作用[10]。 

 

 

其他生物学功能

#04

 

1. 内质网稳态

 

UFL1是唯一犹素化修饰E3连接酶,其缺失会促进内质网应激,抑制自噬降解,并增加活性氧,最终导致造血干细胞的死亡增加。由于UFL1主要在内质网,大多数底物在该细胞器中进行犹素化修饰,维持内质网稳态[11] 。例如,UFBP1 的犹素化通过调节肝内质网应激缓解非酒精性脂肪肝疾病[12]

 

 

2.DNA损伤修复

 

DNA双链断裂(DSBs)修复过程由ATM激酶调控。ATM激酶通过MRE11–RAD50–NBS1(MRN)复合体激活,MRE11在K282位点发生UFMylation,这种修饰在未受干扰的条件下对MRN复合体的形成至关重要,并且在DSB诱导的ATM最佳激活、同源重组介导的修复和基因组完整性中发挥关键作用[13]。 

 

 

植物抗逆

#05

犹素化在植物领域也扮演着重要的角色。研究表明,犹素化E3连接酶Ufl1作为拟南芥在盐胁迫下ATG8的新型相互作用蛋白,对持续盐胁迫下的内质网自噬非常重要:Ufl1功能缺失的突变体表现盐敏感表型,阐明了盐胁迫下犹素化通过内质网自噬调节内质网稳态的功能[14]。 

 

 

总结

犹素化修饰参与了多种生物学过程/功能及病理过程调控,是一种重要的蛋白翻译后修修饰。以上研究报道了犹素化通过影响靶蛋白的泛素化影响蛋白降解/稳定性或通过影响分子互作参与调控的作用机制。目前,犹素化修饰及去修饰过程的相关酶已获得报道,但缺乏能高深度检测细胞中犹素化位点的技术,这也限制了犹素化的进一步研究

中科新生命与独家战略合作伙伴杭州微米生物联合开发了全球首款针对犹素化的修饰组学技术服务,实现对样本中犹素化位点的高深度检测,为研究者提供更高效的研究手段,欢迎咨询!

注:因蛋白犹素化位点赖氨酸K连接的犹素分子在经过胰酶酶切后仅余-GV残基,因此使用特异性K-GV基序抗体富集修饰肽段。

 

 

 

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参考文献

1.doi:10.1186/s13024-025-00855-8

2.doi:10.1038/sj.emboj.7600205

3.doi:10.1038/s41556-020-0559-z

4.doi:10.1038/s41594-025-01576-8

5.doi:10.1016/j.molcel.2024.01.024

6.doi:10.1073/pnas.2215732120

7.doi:10.1002/advs.202406786

8.doi:10.1073/pnas.2011763118

9.doi:10.1186/s13024-024-00784-y

10.doi:10.1093/brain/awy135

11.doi:10.1016/j.pharmthera.2024.108680

12. doi:10.1038/s41419-023-06095-2

13. doi:10.1093/nar/gkz110

14.doi:10.1073/pnas.2208351120