修饰蛋白定量分析 • 犹素化
· 产品定义
犹素化( UFMylation ): 又被称为UFM1修饰。该修饰是在酶的作用下,将犹素(UFM1)分子共价连接到底物蛋白质赖氨酸残基上。参与修饰的酶为E1 UFM1-激活酶 UBA5、E2 UFM1-结合酶UFC1和E3 UFM1-连接酶UFL1。犹素化是一种可逆修饰,去犹素化过程由去修饰酶UFSP蛋白催化。由于UFM1分子和泛素分子在三维结构上高度相似,且都由E1-E2-E3构成的酶系统催化发生,因此是一种类泛素化修饰。
犹素化已被报道在多种生理过程中发挥作用,包括DNA损伤反应(DDR)、内质网(ER)应激反应、调节自噬功能和影响免疫反应。还有证据表明其参与线粒体和核糖体相关的蛋白质质量控制。在肿瘤、免疫&炎症、阿尔茨海默病、缺血性心脏损伤、动脉粥样硬化和脂肪性肝炎等疾病中等发现了犹素化参与的分子调控。
· 技术路线
蛋白犹素化位点赖氨酸(K)连接的犹素分子在经过胰酶酶切后仅余-GV残基,因此使用特异性K-GV基序抗体富集修饰肽段,富集后的肽段使用Astral高端质谱仪进行DIA模式检测。-GV残基会导致赖氨酸K分子质量会相应增加156.089Da,数据库搜索时,根据分子质量偏移,锁定犹素化修饰肽段及位点。
· 数据分析
标准数据分析内容 |
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鉴定分析 |
鉴定与定量结果统计;单个样本蛋白质鉴定结果统计;韦恩图 |
差异表达分析 |
差异结果统计;差异结果柱状图;火山图;聚类分析图 |
功能分析 |
亚细胞定位、结构域分析;GO功能分析、KEGG通路分析;互作网络分析、转录因子分析、激酶分析、WGCNA分析 |
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· 推荐组合产品
1. 蛋白质组+犹素化蛋白质组
2. 犹素化蛋白质组+泛素化蛋白质组
· 推荐应用领域
1. 生理病理过程中的犹素化分子特征分析
2. 疾病分子机制挖掘
· 送样建议
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样本类型 |
推荐送样量 |
动物组织类 |
常规柔软组织:动物心脏、肝脏、脾脏、肾脏、肺、肠、脑组织等 |
≥100mg |
植物组织类 |
植物根、茎、叶、果实等 |
≥1g/样(根和果实适当多送一些) |
细胞样品 |
悬浮/贴壁培养细胞 |
≥5×10^7 |
微生物类 |
真菌菌体 |
≥1.5g |
细菌菌体 |
≥200 mg |
· 参考文献
1. Yan T, Clarkson BD, Lou Z, Springer W, Fiesel FC. The many connections of UFMylation with Alzheimer's disease: a comprehensive review. Mol Neurodegener. 2025;20(1):66. Published 2025 Jun 4. doi:10.1186/s13024-025-00855-8
2. Komatsu M, Chiba T, Tatsumi K, et al. A novel protein-conjugating system for Ufm1, a ubiquitin-fold modifier. EMBO J. 2004;23(9):1977-1986. doi:10.1038/sj.emboj.7600205